Helikopterle çekilen fotoğraflar, Fethiye Körfezi’ndeki derelerin neden olduğu çamur tepelerini gözler önüne serdi. Bilimsel araştırmalar, 2 milyon metreküpten fazla çamur bulunan körfez tabanının her yıl 8 santimetre dolduğunu ortaya koyarken; kirlilik, deniz trafiğini de olumsuz etkiliyor. Yetkililer Çalış bölgesindeki deniz trafiğinin 3-4 yıl içinde tamamen duracağını belirtiyor. Körfezdeki tekneler çamura saplanmamak için belli rotalarda zikzaklar çizerek ilerleyebiliyor.
2012 yılında Muğla Üniversitesi tarafından yapılan bir araştırma 12 kilometre uzunluğundaki körfezde 2 milyon metreküp çamur bulunduğunu ortaya koydu. Araştırmanın sonuç bölümünde tabanı her yıl 8 santimetre dolan Fethiye Körfezi’ne 15 yıl ömür biçildi. Ancak araştırmanın üzerinden 5 yıl geçmesine rağmen Murt Deresi’nin ıslahı dışında körfezin temizliği için atılmış somut bir adım bulunmuyor.